大殿的三寶佛融合中國傳統佛像藝術，

更用現代手法，表現台灣本土精神。

大殿供奉的三寶佛是指東方藥師佛、中央釋迦牟尼佛、西方阿彌陀佛。三尊佛像法相面容相同，差異在於手印的不同，中間的佛陀右手結「說法印」，左手是「持定印」；右尊藥師佛右手是「與願印」，左手為「持定印」；左尊的阿彌陀佛是雙手結「法界定印」，不同手印代表佛的悲願和德行。
三寶佛材質採用青銅，一者具有古樸的風味，能融合於法鼓山建築特色，再者，可避免金山地區天候潮濕的影響。

佛像面容以山東神通寺四門塔的阿閦佛為藍本，這源自法鼓山於二○○二年時，將流失在外的佛頭送回四門塔的因緣，這段因緣不但傳成佳話，也成全了法鼓山在塑佛上的選擇。

三寶佛不但具有中國古代隋唐石窟的佛像藝術，還巧用現代手法，融合了台灣本土特色。瞻仰三寶佛，線條單純，無論面貌、衣紋、姿勢等均莊嚴無比。佛面圓滿，五官適中，尤其是那寬廣的雙肩、結實的胸膛、結跏趺坐的穩重，在在顯示恢弘的氣勢，那是隋唐佛教大化才有的氣勢。

而佛座下的須彌座，在聖嚴師父的指示下，是由直線構成的方形寶座；造型簡單，卻更能襯托大佛後方的舟形光背的富貴華麗，在視覺上更具有震撼力。

看似簡單須彌座，每一面都有栩栩如生的浮雕，三尊共計有十二幅圖畫，裡邊有岩石、溪流、小草、樹林等，配以穗花杉、筆筒樹、野百合等，又有寬尾鳳蝶、藍腹鷳、梅花鹿等暢遊其間，正面正中雕有法輪；藉此突顯台灣寶島的生態豐富，更象徵佛在說法時，所有的眾生和平共處，悠游自在，呈現一處人間淨土。

佛教藝術家陳清香教授即為文表示，這種深具當代意識的圖像語彙，是法鼓山最引以為傲的佛座設計。

除了在造像上所具有的隋唐藝術的大氣，在三尊佛像的佛身中，藏裝有由知名書法家及信眾發心手鈔的七十七卷大乘經典及象徵性的七寶。除象徵有佛寶外，還有法寶，具有庚續佛法慧命的使命感；就像埋藏在佛像正下方法鼓山地宮裡的當代佛教文物，以今人眼光看之，雖不是奇異珍寶，但經過歲月的洗鍊，它所代表的將是當代台灣佛教的文化和歷史，意義可是非常深遠。